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中外科學(xué)家給出基因組學(xué)依據(jù):新冠病毒不是實(shí)驗(yàn)室合成!

發(fā)布日期:2022-04-26 點(diǎn)擊率:97

 2019新型冠狀病毒效果圖來源:美國疾控中心官網(wǎng)

  專家對新冠病毒基因組的兩大顯著特征進(jìn)行了比較分析,這些分析提供了大量證據(jù)推論出:新冠病毒不太可能是實(shí)驗(yàn)室基因工程制造的病毒,而應(yīng)該是病毒自然進(jìn)化的產(chǎn)物。

  疫情當(dāng)頭,關(guān)于2019新型冠狀病毒來自實(shí)驗(yàn)室泄露的傳聞此起彼伏。

  日前,5位國外科學(xué)家在病毒學(xué)論壇“Virological”共同發(fā)布論文,對2019新型冠狀病毒的基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,指出2019新型冠狀病毒不是實(shí)驗(yàn)室合成的,也不是一種被故意操縱的病毒。目前,論文還未經(jīng)過正式的同行評議。

  這5位科學(xué)家包括美國哥倫比亞大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院感染與免疫中心主任、被譽(yù)為“病毒獵手”的伊恩·利普金。此外還有4位來自美國斯克里普斯研究所、英國愛丁堡大學(xué)、澳大利亞悉尼大學(xué)、美國杜蘭大學(xué)的生物學(xué)或免疫學(xué)研究人員。

  論文指出,與其他冠狀病毒相比,2019新型冠狀病毒的基因組存在兩個顯著特征。隨后文章從這兩大特征入手,分析了為何2019新型冠狀病毒不太可能來自實(shí)驗(yàn)室合成。

  S蛋白與受體的結(jié)合方案,不同于人工預(yù)測

  2019新型冠狀病毒的第一個特征是,根據(jù)結(jié)構(gòu)模型和早期生化實(shí)驗(yàn),這種病毒似乎為了結(jié)合人類的ACE2受體而得到優(yōu)化。

  這里有必要科普一下,此前有研究發(fā)現(xiàn),2019新型冠狀病毒和SARS病毒都是通過刺突蛋白(S蛋白)與人體ACE2受體結(jié)合,介導(dǎo)病毒進(jìn)入人體細(xì)胞。

  中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所副所長、北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院免疫學(xué)系副主任黃波介紹,S蛋白是位于冠狀病毒表面的一種蛋白,放大后像釘子。ACE2則是位于人體肺部上皮細(xì)胞表面的一種蛋白。

  這些國外專家提出:“SARS病毒和SARS相關(guān)冠狀病毒S蛋白中的受體結(jié)合域(RBD)是病毒基因組中最容易變異的部分。這些受體結(jié)合域中的6個殘基似乎對與人體ACE2受體結(jié)合以及確定宿主范圍至關(guān)重要。”

  論文中說,2019新型冠狀病毒S蛋白基因序列中486殘基處的苯丙氨酸,與SARS病毒S蛋白基因序列中的L472相對應(yīng)。在SARS病毒細(xì)胞培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)中,L472可以突變?yōu)楸奖彼帷4饲暗难芯款A(yù)測,這是SARS病毒的受體結(jié)合域與人體ACE2受體結(jié)合的最佳方案。然而,這種位置的苯丙氨酸也存在于蝙蝠身上的一些類SARS冠狀病毒中。

  此外,2019新型冠狀病毒受體結(jié)合域中的幾個關(guān)鍵殘基,與之前研究曾描述的與人體ACE2受體結(jié)合的最佳殘基不一樣。但最新研究卻表明,2019新型冠狀病毒與人體ACE2結(jié)合的親和力很高。

  這說明什么?“2019新型冠狀病毒的S蛋白似乎是對人或類似人ACE2的自然選擇的結(jié)果,從而出現(xiàn)了不同于預(yù)測的最佳結(jié)合方案。這有力地證明了2019新型冠狀病毒不是基因工程的產(chǎn)物。”論文作者稱。

  S蛋白上的酶切位點(diǎn),可以通過自然變異獲得

  2019新型冠狀病毒的第二個特征是,在這種病毒具有高度變異性的S蛋白上,插入了12個核苷酸,而且存在一個可疑的酶切位點(diǎn)。

  “通常情況下,存在這樣的酶切位點(diǎn)被看作人工基因工程的痕跡。但是對禽流感病毒的研究發(fā)現(xiàn),病毒在自然進(jìn)化的過程中,也可以獲得酶切位點(diǎn)。”南開大學(xué)生命科學(xué)院副教授高山的研究方向?yàn)樯镄畔W(xué),他在接受科技日報記者采訪時如是說。

  上述論文提到,這種酶切位點(diǎn),在病毒快速復(fù)制和傳播的自然選擇環(huán)境下,例如在高度密集的雞群中,可以在禽流感病毒血凝素(HA)蛋白的兩個亞基的接合處獲得。流感病毒HA蛋白在細(xì)胞培養(yǎng)或動物體內(nèi)反復(fù)強(qiáng)制傳代后,也可以觀察到酶切位點(diǎn)的獲得。

  論文提出,通過插入或重組而獲得HA蛋白中的酶切位點(diǎn),可將低致病性禽流感病毒轉(zhuǎn)化為高致病性禽流感病毒。同樣,新城疫病毒的一個無毒分離物在雞的連續(xù)傳代過程中,可以在其融合蛋白亞基的連接處逐漸獲得一個酶切位點(diǎn),從而變得高度致病。

  “這意味著,一旦獲得酶切位點(diǎn),這些病毒相當(dāng)于進(jìn)行了一次升級,有可能提高其傳染能力。”高山說。

  與這篇國外專家的論文遙相呼應(yīng),早在1月27日,高山就與多位研究人員共同在中科院科技論文預(yù)發(fā)布平臺ChinaXiv上提交研究發(fā)現(xiàn):2019新型冠狀病毒S蛋白可能存在弗林(Furin)蛋白酶切位點(diǎn)。

  高山介紹,他們的研究發(fā)現(xiàn),2019新型冠狀病毒的S蛋白可能存在弗林蛋白酶切位點(diǎn),從而導(dǎo)致它的感染機(jī)制不同于SARS等大部分β冠狀病毒。由于感染機(jī)制的改變,2019新型冠狀病毒獲得了更高的進(jìn)入細(xì)胞的效率,這可能是其傳播能力大于SARS病毒的原因之一。

  “我們還意外地發(fā)現(xiàn),一些禽流感病毒可以通過突變獲得弗林蛋白酶切位點(diǎn),這說明自然突變可以引入弗林蛋白酶切位點(diǎn)。”高山說。

  O-聚糖結(jié)構(gòu)的產(chǎn)生,通常需要免疫系統(tǒng)參與

  “2019新型冠狀病毒不太可能是通過實(shí)驗(yàn)室操作現(xiàn)有的SARS相關(guān)冠狀病毒而出現(xiàn)的。”這些國外專家說。

  專家們指出,如果進(jìn)行了基因操縱,人們可以預(yù)期,可用于β冠狀病毒的幾個反向遺傳系統(tǒng)中的一個將被使用。然而,情況并非如此,因?yàn)檫z傳數(shù)據(jù)顯示,2019新型冠狀病毒并非來自任何先前使用的病毒主干。

  這幾位國外專家提出了兩種可能的情況來解釋2019新型冠狀病毒的起源:第一種是在人畜共患傳染病轉(zhuǎn)移之前,在非人類動物宿主中自然選擇的結(jié)果;第二種是在人畜共患傳染病轉(zhuǎn)移之后,在人類中自然選擇的結(jié)果。

  那么,實(shí)驗(yàn)室到底有沒有能力設(shè)計或合成病毒?“從技術(shù)上講,是沒有問題的。”高山告訴科技日報記者。

  對此,這篇國外論文也進(jìn)行了分析。“多年來,在世界各地的多個BSL-2(生物安全第二等級)實(shí)驗(yàn)室都進(jìn)行了有關(guān)蝙蝠SARS樣冠狀病毒在細(xì)胞培養(yǎng)和/或動物模型中傳代的基礎(chǔ)研究。還記錄了在BSL-2密閉環(huán)境下工作的實(shí)驗(yàn)室人員在實(shí)驗(yàn)室獲得SARS病毒的實(shí)例。因此,我們必須考慮有意或無意釋放2019新型冠狀病毒的可能性。”論文稱。

  但專家們隨后對這種可能性也進(jìn)行了質(zhì)疑。

  他們指出,通過細(xì)胞培養(yǎng)或動物傳代產(chǎn)生2019新型冠狀病毒,需要事先分離具有高度遺傳相似性的前體病毒。隨后產(chǎn)生的酶切位點(diǎn)需要在細(xì)胞培養(yǎng)中,或者具有與人類相似的ACE2受體的動物(如雪貂)中進(jìn)行密集的傳代程序。

  然而,2019新型冠狀病毒S蛋白由于存在酶切位點(diǎn),導(dǎo)致酶切位點(diǎn)周圍存在3個O-聚糖結(jié)構(gòu)。“值得懷疑的是,O-聚糖結(jié)構(gòu)的產(chǎn)生是否會發(fā)生在細(xì)胞培養(yǎng)過程中,因?yàn)檫@種突變通常意味著免疫系統(tǒng)的參與,而這種免疫系統(tǒng)在體外是不存在的。”這些國外專家稱。


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